Alle sind im Universum auf der Suche nach den Chaos Emeralds unterwegs. Knuckles stellt eine Veränderung am Master Emerald fest. Es muß ein Chaos Emerald in der Nähe sein. Sie finden den Planeten Secco. Doch zum Entsetzen von Sonic besteht die Oberfläche hauptsächlich aus Wasser. Knuckles macht sich zusammen mit Cream, Amy, Cheese und Cosmo an Land auf die Suche. Sonic und Chris wollen ihr Glück im U-Boot unter Wasser versuchen. Doch fischartige Metarex überfallen sie. Amy kann Sonic rettet. Es gelingt auch den Emerald zu finden